สำหรับโครงการแบบ Mutually Exclusive (เลือกได้โครงการเดียว) ต้องตัดสินใจบนฐาน NPV
เพราะเหตุผล 3 ข้อ
1. เป้าหมายของบริษัทคือเพิ่มมูลค่าเป็นจำนวนเงิน
2. ข้อสมมติการนำเงินไปลงทุนต่อ (Reinvestment Rate)
3. IRR มีปัญหาเรื่อง Multiple IRR
ดังนั้นเมื่อ NPV และ IRR ให้ผลขัดแย้งกันในโครงการแบบ Mutually Exclusive ให้เชื่อ NPV เสมอ เพราะเป็นการตัดสินใจที่ทำให้มูลค่ากิจการสูงสุด